Meny

Fire bdelloidrotiferer i slekten Adineta
Cg Wilson 2018

i 2016 foreslo en studie at bdelloid rotatorier dyrker Genetisk Mangfold Ved Å Dele Dna Mellom Seg Selv Via Horisontal Overføring. Men i arbeid publisert i dag (12. juli) i Current Biology, identifiserer et eget forskerteam sannsynlig forurensning i rådataene fra den første rapporten, utfordrer konklusjonene og belyser behovet for videre etterforskning.”Vi vet at bdelloidrotiferer er veldig rare dyr, så historien virket mulig ved første øyekast,” sier Chris Wilson, en evolusjonær biolog Ved Imperial College London og medforfatter av det nye papiret. “Vi har lenge kjent at de har mye uventet fremmed DNA i sine celler som er blitt stjålet fra ting som planter og bakterier, så for mange mennesker virket det naturlig at DE også kan bytte DNA med hverandre.”

Bdelloid rotatorier er mikroskopiske, ferskvannsdyr funnet rundt om i verden. Og selv om de har eksistert i minst 80 millioner år, har de ikke hatt mye sex-i hvert fall så langt som forskere kan fortelle. “Denne morsomme lille akvatiske organismen er veldig spesiell,” sier Matthew Meselson, en evolusjonær biolog Ved Harvard University som ikke deltok i begge studier, da det tillater forskere å undersøke spørsmålet, “hva er seksuell reproduksjons rolle i evolusjonen? Det er et stort problem i evolusjonsteorien.”

uansett hva deres reproduktive modus er, til slutt gjør det dem ikke mindre interessante.

—Tanja Schwander, University of Lausanne

Dyr som reproduserer aseksuelt, eksisterer sikkert, men for å bevare mangfoldet trenger De en måte å utveksle genetisk informasjon på, eller de risikerer å dø ut. En mulighet forskere har sett på er horisontal genoverføring-bytte DNA MELLOM individer, i stedet for å overføre DET fra foreldre til avkom.

Mens 2016-resultatene virket troverdige, gjorde Et par ting Wilson og hans kolleger spørsmålet om funnene. For det første viste det seg at giverne og mottakerne for de foreslåtte horisontale overføringene alle var samlet fra samme park I Belgia og sekvensert for 2016-papiret. Wilson sier at du kanskje forventer at noen av disse dyrene har hentet DNA FRA andre dyr som ikke ble samlet på samme tid. Denne ryddige justeringen pekte på ideen om at hva forfatterne av den opprinnelige studien refererer til som bevis for horisontal overføring, kan faktisk representere forurensning mellom rør i laboratoriet i stedet for gendeling som skjer i naturen.”DET var også litt overraskende AT DNA fra ett dyr og dette andre dyret ville være identisk fortsatt, selv om de er forskjellige arter,” Sier Wilson. “Vi lurte på hvorfor INGEN AV DNA hadde endret seg siden det ble byttet, hvorfor det akkurat matchet dette andre dyret som skjedde å bli brakt inn i samme laboratorium samtidig.”

For å undersøke om det kan være en enklere forklaring på resultatene, kontaktet Wilson Og kollegaer forfatterne av 2016—studien og ba om kromatogramfargede topper som representerer de rå dataene som genereres av Sanger-sekvensering. Forfatterne delte raskt sine kromatogrammer, Som Wilson og kolleger analyserte. De la merke til at rådataene var støyende, noen ganger med flere topper som representerer mer ENN ETT DNA-nukleotid i samme posisjon i sekvensen, en tidlig anelse om at det kan være forurensning. Wilson og hans kolleger fulgte opp med en statistisk test der de matchet sekundære blips i dataene mot den forutsagte DNA-sekvensen til de andre dyrene som kan forurense prøven og deretter beregnet sannsynligheten for å se en kamp bare ved en tilfeldighet. Det viste seg at oddsen var mindre enn 1 trillion til en at støyen i rådataene ville være den samme som en genetisk sekvens av en annen rotator. Deres konklusjon: DET må VÆRE DNA fra to dyr i samme rør.

det andre laget er ikke helt enig, selv om tilleggsanalysen har gitt nyttig ny informasjon. “Noe jeg skjønte takket være denne vitenskapelige utvekslingen med våre kolleger Fra London, er at de fleste antar at disse små toppene på bunnen av kromatogrammene bare er tilfeldig støy der det egentlig ikke er,” sier Jean-Franç Flot, en evolusjonær biolog Ved Universiteteté Libre De Bruxelles I Belgia og medforfatter på 2016-studien. “Det er ikke tilfeldig. Er det viktig? Det er et annet spørsmål. Det er ikke klart fra dataene de viser at dette virkelig påvirker vår analyse.”Flot Og kolleger har utarbeidet et svar på reanalysen av deres data som de planlegger å frigjøre som preprint, der de gir forklaringer på Noen av problemene som Wilsons team reiser og diskuterer alternative tolkninger. “På lang sikt vil dette være en god ting for vitenskapen,” Sier Flot.

“det store bildet er . . . at hvorvidt bdelloider utveksler DNA—eller deres grad av aseksualitet—er fortsatt et stort, bredt åpent spørsmål,” Sier David Mark Welch, en evolusjonær biolog ved Marine Biological Laboratory I Woods Hole, Massachusetts, som ikke var involvert i begge studier. Han sier at forskningsarbeidet fra disse to gruppene viser at ” selv for folk som er gode og forsiktige, er det ekstremt vanskelig å jobbe med disse små dyrene.”

Når Det gjelder hva som faktisk skjer under bdelloid reproduksjon, “verken det opprinnelige papiret eller dette svaret viser at bdelloider ikke engasjerer seg i horisontal overføring,” Legger Mark Welch til. “Vi mistenker alle at de gjør det, men det som peker på er at bevisene som ble presentert i originalpapiret, er lettere forklart og nesten sikkert sannsynligvis skyldes forurensning.”sannsynligheten for at det er noen form for genetisk utveksling skjer er ganske sannsynlig,” enig Tanja Schwander, en evolusjonær biolog Ved Universitetet I Lausanne I Sveits som forfattet et perspektiv om 2016-studien For Nåværende Biologi. “Spørsmålet er egentlig: hvor ofte skjer disse genetiske utvekslingene? Har de faktisk bidra til generering av variasjon innenfor . . . rotatorier eller er det noe som virkelig skjer så sjelden at det er for sjelden faktisk å ha kontinuerlig innvirkning? Uansett hva deres reproduktive modus er, til slutt gjør det dem ikke mindre interessante.”

C. G. Wilson et al., “Krysskontaminering forklarer” inter-og intraspesifikke horisontale genetiske overføringer “mellom aseksuelle bdelloidrotiferer,” Current Biology, doi: 10.1016 / j. cub.2018.05.070, 2018.

Legg igjen en kommentar

Din e-postadresse vil ikke bli publisert.