Menu

Adineta属の4つのbdelloidワムシ
C.G.Wilson2018

2016年に、bdelloidワムシは、水平方向のDNAを介してDNAを共有することによって遺伝的多様性を育成することが示唆された研究では、bdelloidワムシは、水平方向のDNAを共有することによって遺伝的多様性を育成することが示唆された。転送。 しかし、Current Biologyの今日(7月12日)に発表された研究では、別の研究チームが最初の報告書から生データの汚染の可能性を特定し、その結論に挑戦し、さらなる調査の必要性を明らかにしました。インペリアル-カレッジ-ロンドンの進化生物学者であり、新しい論文の共著者であるChris Wilsonは、”bdelloidワムシは非常に奇妙な動物であることを知っているので、一見すると物語は可能であるように見えた”と述べている。 「たとえば、植物や細菌などから盗まれた予期せぬ外国のDNAが細胞にたくさんあることは、長い間知っていましたので、多くの人にとって、DNAを交換してい”

Bdelloidワムシは、世界中で発見された微視的な淡水動物です。 そして、彼らは少なくとも80万年前から存在していたにもかかわらず、少なくとも科学者が言うことができる限り、多くのセックスをしていません。 “この面白い小さな水生生物は非常に特別です”と、ハーバード大学の進化生物学者であるMatthew Meselsonは、研究者が”進化における有性生殖の役割は何ですか? それは進化論の大きな問題です。”

彼らの生殖モードが何であれ、最終的にはそれらをあまり面白くしません。

—Tanja Schwander、ローザンヌ大学

無性生殖する動物は確かに存在しますが、多様性を維持するためには、遺伝情報を交換する何らかの方法 科学者が調べた1つの可能性は、親から子孫に渡すのではなく、個人間でDNAを交換する水平遺伝子導入です。2016年の結果はもっともらしいように見えましたが、ウィルソンと彼の同僚は調査結果に疑問を呈しました。

第一に、提案された水平転送のためのドナーと受信者はすべてベルギーの同じ公園から収集され、2016の論文のために配列決定されていたようです。 ウィルソンは、あなたがこれらの動物のいくつかが同時に収集されなかった他の動物からDNAを拾ったと予想するかもしれないと言います。 この整然とした整列は、元の研究の著者が水平移動の証拠と呼んでいるものが、実際には自然界で起こっている遺伝子共有ではなく、実験室の管間の汚染を実際に表しているかもしれないという考えを指摘した。「ある動物とこの他の動物のDNAが、異なる種であっても同じであることも少し驚くべきことでした」とWilson氏は言います。 「私たちは、なぜDNAが交換されてから変化しなかったのか、なぜ同時に同じ実験室に持ち込まれた他の動物と正確に一致したのか疑問に思いました。”

結果の簡単な説明があるかどうかを調べるために、Wilsonらは2016年の研究の著者に連絡し、Sanger sequencingによって生成された生データを表すクロマトグラム色のピークを要求した。 著者らはすぐにWilsonらが分析したクロマトグラムを共有した。 彼らは、生のデータがノイズが多く、時には配列内の同じ位置にある複数のDNAヌクレオチドを表す複数のピークがあり、汚染がある可能性があるという初期の手掛かりであることに気づいた。 ウィルソンと彼の同僚は、彼らがサンプルを汚染する可能性があり、他の動物の予測されたDNA配列に対して、データ内の二次ブリップを一致させ、その後、偶然に一致を見る確率を計算した統計的なテストをフォローアップしました。 生データのノイズが別のワムシの遺伝的配列と同じであることは、オッズが1兆未満であることが判明しました。 彼らの結論:同じチューブ内に二つの動物からのDNAがなければなりません。追加の分析は有用な新しい情報を提供していますが、他のチームは完全に同意していません。

ベルギーのBruxelles Libre大学の進化生物学者であり、2016年の研究の共著者であるJean-François Flot氏は、「ロンドンの同僚とのこの学術的交流のおかげで、ほとんどの人がクロマトグラムの下部にあるこれらの小さなピークは、実際にはランダムなノイズではないと仮定しているということです」と述べています。 “それはランダムではありません。 それは重要ですか? それは別の質問です。 彼らが示しているデータから、これが私たちの分析に本当に影響することは明らかではありません。”

Flotらは、Wilsonのチームが提起した問題のいくつかについて説明し、代替解釈について議論するプレプリントとしてリリースする予定のデータの再分析に対 「長期的には、これは科学にとって良いことになるでしょう」とFlot氏は言います。

“大きな画像です。 . . どちらの研究にも関与していなかったマサチューセッツ州ウッズホールの海洋生物研究所の進化生物学者であるDavid Mark Welchは、bdelloidsがDNAを交換しているかどうか、 彼は、これら二つのグループの研究努力は、”良いと慎重である人々のためにも、これらの小動物との作業は非常に困難であることを示していると言います。”

bdelloid再生中に実際に何が起こるかという点では、”元の論文もこの応答も、bdelloidが水平転送に従事していないことを実証していません”とMark Welchは付け加えます。 「私たちは皆、彼らがそうしていると疑っていますが、指摘しているのは、元の論文で提示された証拠がより簡単に説明され、ほぼ確実に汚染によるものである可能性が高いということです。”

“遺伝的交換のいくつかのフォームが起こっている可能性は非常に可能性が高いです、”tanja Schwander、現在の生物学のための2016年の研究についての視点を書 “質問は本当にです:これらの遺伝的交換がどの頻度で起こるのですか? 彼らは実際に内の変化の生成に貢献していますか。 . . rotifersまたはそれは実際に連続的な影響を持つには余りにもまれ実際にであるほどまれに起こる何かであるか。 彼らの生殖様式が何であれ、最終的にそれはそれらをあまり面白くしません。”

C.G.Wilson et al.、”交差汚染は、無性bdelloidワムシの間の”種間および種内水平遺伝的伝達”を説明する”Current Biology、doi:10.1016/j.cub。2018.05.070, 2018.

コメントを残す

メールアドレスが公開されることはありません。